En parallèle de sa maîtrise d’Information et Communication et de la préparation d’un master d’Etudes théâtrales, Manon Savary commence à travailler en 2001 comme assistante à la mise en scène de Jérôme Savary pour la création de la comédie musicale Chano Pozo au Teatro America à La Havane.

Elle poursuit son travail d’assistanat mise en scène avec Alfredo Arias sur la création de Madame de Sade de Yukio Mishima au Théâtre National de Chaillot en 2004, puis sur la création de Mambo mistico toujours au Théâtre National de Chaillot en 2005.

La même année elle est engagée par Henri-Jean Servat comme assistante mise en scène sur la création de l’opéra La Traviata de Verdi en tournée en France et en Belgique.

Elle prolonge sa collaboration avec Jérôme Savary sur différents événements. En 2006, elle fait sa première mise en scène. Invitée par Jacques Garcia dans le théâtre de verdure de son château de Champ de Bataille, elle monte L’Illusion comique de Corneille.

Elle fonde en 2007 sa propre compagnie MFSM et en 2008, elle entame une collaboration avec Mona Heftre sur Albertine Sarrazin au Théâtre Municipal de Béziers, au Printemps des Comédiens à Montpellier puis aux Déchargeurs.